菲律宾现存最古老的石头建筑教堂。在1586年批准建设计划。施工开始于1587年在奥古斯丁的父亲和佛朗西斯科·巴斯托斯的监督下最终于1607年建设完成。
方索·佩雷斯,圣地亚哥德阿维拉和弟弟阿龙去佩雷亚,其架构设计师娟马西亚斯- TECT是娟马西亚斯。从1645年至2023年它经受住了多次地震,并在1762年英国入侵中幸存下来。
在1898年美西战争和日本侵略中也得以幸免。1942年:教堂唱诗班有68个刻莫拉菲座椅叙事嵌花。在17和18世纪的艺术LEC燕鸥和羊皮纸cantorals(貌似不是英语.求翻译) 。1762年期间英国占领马尼拉并对教会和坟墓进行了亵渎。
早期西班牙征服者黎牙实比,萨尔塞多, lavezares(人名) ,祝福佩德罗版祖尼加和其他人的骨灰安息在耳堂的教堂东端。
1898年美国占领马尼拉在给予教堂编制条款。
1953年第一次菲律宾全体议会在这里举行。
1993年联合国教科文组织将圣奥古斯丁教堂选为世界遗产。